Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClspnQ80YR7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClspnQ80YR7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms