Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5bQ80Y84 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5bQ80Y84 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5bQ80Y84 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5bQ80Y84 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms