Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrfn4Q80XU8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms