Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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