Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc116Q80X53 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc116Q80X53 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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