Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc1Q80VQ1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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