Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp8Q80U87 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp8Q80U87 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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