Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Avl9Q80U56 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Avl9Q80U56 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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