Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42bpbQ7TT50 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms