Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2q1Q7TSS2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms