Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms