Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf516Q7TSH3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms