Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms