Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek5Q7TSC3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek5Q7TSC3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms