Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms