Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sbno2Q7TNB8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms