Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms