Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mindy1Q76LS9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mindy1Q76LS9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mindy1Q76LS9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mindy1Q76LS9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms