Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cspg5Q71M36 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspg5Q71M36 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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