Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SynmQ70IV5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms