Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms