Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf3Q6ZQA6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms