Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rhox8Q6VSS7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhox8Q6VSS7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhox8Q6VSS7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhox8Q6VSS7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhox8Q6VSS7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhox8Q6VSS7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhox8Q6VSS7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhox8Q6VSS7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhox8Q6VSS7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms