Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms