Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GcsamQ6RFH4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GcsamQ6RFH4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GcsamQ6RFH4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GcsamQ6RFH4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GcsamQ6RFH4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GcsamQ6RFH4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GcsamQ6RFH4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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