Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Med16Q6PGF3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms