Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PdgfrlQ6PE55 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PdgfrlQ6PE55 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PdgfrlQ6PE55 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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