Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q6PD19 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q6PD19 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q6PD19 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms