Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms