Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpsf6Q6NVF9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpsf6Q6NVF9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms