Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms