Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr44Q6NVE8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms