Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSV7

Fam149b1, Protein FAM149B1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam149b1Q6NSV7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam149b1Q6NSV7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam149b1Q6NSV7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms