Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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