Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt39Q6IFX4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms