Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil1Q6EDY6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil1Q6EDY6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms