Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms