Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Sp9Q64HY3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sp9Q64HY3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sp9Q64HY3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sp9Q64HY3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp9Q64HY3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sp9Q64HY3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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