Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprcapQ64697 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms