Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top2bQ64511 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms