Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms