Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca4Q64444 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms