Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tbr1Q64336 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms