Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms