Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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