Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col4a5Q63ZW6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms