Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf260Q62513 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf260Q62513 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Znf260Q62513 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf260Q62513 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms