Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Lcn4Q62472 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn4Q62472 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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