Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lcn3Q62471 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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