Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms